Goya en tiempos de guerra plantea una amplia reflexión sobre un período de extraordinaria creatividad en la larga trayectoria artística de Francisco de Goya, que abarca desde 1799, año en que fue nombrado primer pintor de cámara, hasta 1819, fecha en que cae enfermo y se retira de la vida pública, y, aunque la Guerra de la Independencia es parte central del argumento de esta obra, el arco temporal se amplía para englobar otras guerras y acontecimientos de esa época fundamentales para una total comprensión del entramado de fondo ante el que se perfila la vida y la obra del pintor. La figura de Goya se analiza a través de los estudios en profundidad de casi doscientas obras esenciales de este período, en los que se presentan las novedades descubiertas en una investigación previa que incluía la reunión de nuevos datos documentales y la realización de análisis técnicos y restauraciones de una parte de las obras expuestas, principalmente de los cuadros del Dos y Tres de Mayo de 1808.